Los proyectos que lidera, coordina o comparte Ayllu, se enmarcan principalmente en la construcción de redes, la mejora de relaciones, en procesos comunitarios y la gestión alternativa de conflictos. 

Uno de los proyectos mas ambiciosos que AYLLU tiene en marcha para 2009, Año Internacional para la Reconciliación, es el proyecto “La reconciliación como parte fundamental para la reconstrucción de realidades socialmente fracturadas y como lógica de actuación en un contexto de respeto a los Derechos Humanos”. Es un proyecto ambicioso, pues pretende la colaboración de todas las universidades Catalanas a través de diferentes Cátedras asociadas, con la coordinación y el asesoramiento de los técnicos de AYLLU. Lo que pretende el proyecto es buscar las claves que han llevado a la reconciliación en países donde la violencia ha aflorado en forma de conflicto armado entre su población.
Los objetivos del proyecto son:

• Profundizar en los procesos de reconciliación social que han echo posible llevar a cabo en diferentes países que han sufrido confrontaciones armadas y que han superado esta situación mediante un procesó de reconciliación.
• Sensibilizar a sectores significativos de la población alrededor de la importancia de la reconciliación delante procesos de confrontación social y comunitaria.
  
• Crear un espacio de investigación y debate, con la participación de expertos de diferentes universidades catalanas, que permita proporcionar sostenibilidad futura al desarrollo de ideas y nuevos materiales relacionados con procesos de reconciliación y negociación, tanto en el ámbito de los conflictos públicos y comunitarios como en el desarrollo de actitudes personales que respondan a esta orientación.
  

Este proyecto se inicia en 2009 y tiene una periodicidad estimada de 2 años.

El comité científico y experto inicial es el siguiente:

Jaume del Campo: profesor de pedagogía de la Universidad de Barcelona (Catalunya), especialista en gestión y resolución de conflictos e intervención educativa. Miembro de GREDI, Grup de Recerca en Educació Intercultural. Coordinador de proyectos de cooperación universitarios en El Salvador

Josep Mª Terricabras: Catedrático de filosofía de la Universidad de Girona (Catalunya) y director de la Cátedra Ferrer i Mora de Pensament Contemporani. Es miembro de la Sociedad Catalana de Filosofía. Especializado en filosofía del lenguaje, lógica, teoría del conocimiento y ética. Asesor de la Revista de Catalunya y presidente del Comité de Seguimiento de la Declaración Universal de los Derechos Lingüísticos.

Antoni Blanc: profesor titular de Dret Internacional Públic de la Universidad de Lleida (Catalunya) y Personal Investigador (IP) del grupo de recerca sobre la reforma de las Naciones Unidas. Presidente de la Associació per a les Nacions Unides a Lleida.

Bénédicte Real: Investigadora post-doctoral de la Cátedra Jean Monnet “Law and External Relations of the European Union”. Miembro del grupo de recerca y de la Associació per a les Nacions Unides.

Este equipo recibe el apoyo del equipo técnico de AYLLU.